Une épidémie régionale de S. Typhimurium au Danemark : identification de la source par typage MLVA

Au Danemark, dans le cadre du système national de surveillance microbiologique des infections entériques, le sous-typage de tous les isolats de S. Typhimurium est en cours par lysotypage, typage par antibiogramme et électrophorèse en champ pulsé (PFGE). Cependant, pour certain lysotypes, la capacité discriminatoire du PFGE est insuffisante, et il n’est pas toujours possible de séparer les isolats associés des isolats non associés. C’est pourquoi, depuis 2004, nous avons appliqué la méthode de sous-typage MLVA (multiple locus variable number of tandem repeats analysis) pour la surveillance des isolats de S. Typhimurium. Une épidémie de 26 cas de S. Typhimurium a ainsi été identifiée par cette méthode en mai et juin 2005. Les isolats correspondant à l’un des lysotypes (DT12) et de même profil PFGE les plus fréquents au Danemark, étaient sensibles à tous les antibiotiques. Les souches de S. Typhimurium DT12 obtenues dans le cadre de la surveillance en routine chez les animaux et dans les aliments ont été analysées par MLVA et PFGE afin de les comparer aux isolats humains. Les résultats du typage ont mis en évidence une parfaite similitude (même PFGE et même type MLVA) entre les isolats humains et un isolat provenant d’un élevage porcin et de l’abattoir correspondant, situé dans la région où a eu lieu l’épidémie. En revanche, les autres isolats DT12 analysés qui partageaient le même profil en PFGE, différaient lors de l’analyse MLVA. L’hypothèse que l’élevage porcin était la source des infections humaines, a été étayée par les informations sur les patients. La viande de cet élevage a été interdite à la vente le 29 juin. L’analyse par MLVA peut donc contribuer efficacement à la surveillance aussi bien qu’aux investigations d’épidémies de S. Typhimurium. En effet, sans cette méthode de typage, l’épidémie n’aurait pu être ni détectée, ni sa source identifiée.